二代掌控木叶之初，建立了暗部。
暗部云集了众多优秀忍者像kku等忍者，其中，卡卡西，宇智波鼬等优秀忍者更是进入过暗部。
暗部类似于现代世界的特种军队部门，主要进行保护影和预防外放侵入忍村的工作，有时还负责侦查敌情和暗杀等任务。
由于任务的特殊性，其成员行动时都戴着模仿动物的白色面具，任务性质以及其他一切资料均被机密保存。
暗部服装，通常身穿黑色紧身衣，外面穿一件黑色背带衫，下装基本与其他忍者无异，有时也会套一件黑色风衣，分队队长的风衣或是米黄色。
如果说，暗部是大树的底，而根部，则是生活在地下的根，由志村团藏掌控。
木无根，何来叶。
为了和平，为了木叶，他杀了很多人，该杀的，不该杀的人，他都杀了，双手沾满了鲜血。
他曾经说过那么一句话，你是沐浴阳光的木叶，我是黑暗中的根。
但事实上，很多时候，他是为了自己，为了自己的野心。
距离叶枫出村子，已经过了快要一个时辰了，钟表，已经走到了4点的时刻。
团藏拄着拐杖，阴沉着脸站在火影的办公室中，与对面的人据理力争着，而他的对面，坐着的赫然便是三代火影，猿飞日斩。
“猿飞，叶枫他狼子野心，非我木叶之人，你怎么...”团藏说着还用拐棍敲打着地板，以表示心中的怒火。
“团藏！”猿飞日斩低喝一声，幽冷目光，如同针刺：“你没有听到我的命令吗？”
“我让你不要在去杀叶枫，你是不是没有听到？！”
“不敢。”团藏见猿飞日斩动了真怒，不由心中一颤，服了一个软。
“那你派出的两名根部的忍者是怎么回事？”
“这.....”团藏语塞了起来，然后额头上便渐渐的流出了汗水。
“别以为你做的那些事我都不知道！”猿飞日斩拍了一下桌子：“这是最后一次，如果在有下次，你就把根部交出来吧。”
团藏看向猿飞日斩，见猿飞日斩的表情一脸认真，知道他不是在开玩笑，闷声应了一声。
猿飞日斩点了点头继续道：“根部的那两人，我已经派暗部去拦了，你也发一道信息，让他们不要反抗。”
“是...”团藏深吸了一口气，他知道，他这一次，是真的栽了。
猿飞日斩看着团藏离去的背影，挤成一团的眉头却一丝也没有放松，反而更加的紧了。
“他对木叶，太重要了啊.....”
团藏退下回到自己的大本营，也就是根部所在之后。
刚一站在进入正门中的木桥上，一名忍者连忙呈上了一杯上好的茶水。
团藏闻都未闻，直接将杯子拿起，然后摔在了地上，脸色阴沉，低声咆哮：“叶枫小狗，咱们走着瞧！你的眼睛，你的命，都是我的！”
几名根部忍者听到团藏的咆哮，吓得连忙跪匍在地，大气都不敢喘一声。
“给寺井和佐井发信号，让他们回来，不要动叶枫了！”